CO23: Genética y Enfermedades Neurodegenerativas

El grupo de Genética y Enfermedades Neurodegenerativas tiene como objetivo discernir las principales vías genéticas afectadas en la enfermedad de Parkinson y otros trastornos neurodegenerativos. Para ello utilizaremos la secuenciación de transcriptoma de célula única (single cell RNA sequencing), que nos permitirá describir las principales alteraciones genéticas con especificidad de tipo celular, utilizando tanto tejido cerebral postmortem de pacientes, como células de muestras de fluidos periféricos donados por pacientes, como tejido de modelos animales. Los datos serán validados utilizando técnicas histológicas como immunofluorescencia e hibridación in situ, y técnicas de transcriptómica espacial como in situ sequencing. La alta sensibilidad de las técnicas utilizadas nos permitirá determinar los tipos celulares más afectados y qué genes presentan una mayor implicación, lo que guiará a la exploración de nuevas dianas terapéuticas y vías de tratamiento.

El grupo es un grupo mixto de investigadores básicos (3) e investigadores clínicos (3). Los investigadores básicos son: la responsable del grupo, Ana Muñoz Manchado, investigadora Ramón y Cajal de la UCA, experta en la secuenciación de transcriptoma de célula única y técnicas asociadas, y dos doctorandos que se van a unir a ella en los próximos meses. En conjunto reunirán las habilidades necesarias para la generación de los datos de transcriptoma de célula única y su análisis bioinformático. Uno de los doctorandos está asociado a una FPI del plan propio de la UCA para Ramones y Cajales, y el otro doctorando a la FPI asociada al proyecto del Ministerio concedido a la responsable de grupo. Ambas convocatorias están cerradas y el proceso de selección en marcha. Los otros 3 miembros del grupo son investigadores clínicos, (médicos especialistas en Neurología): Andrés, Beatriz y Alicia, pertenecientes al Servicio de Neurología del hospital Universitario Puerta del Mar, con acceso a muestras de pacientes, y que aportarán el conocimiento necesario para relacionar los datos genéticos con los cuadros sintomáticos de los pacientes, alteraciones anatómicas e histológicas. Con esta mezcla y diversidad de conocimiento ambicionamos establecer un puente directo entre la investigación básica y la clínica en un cuadro de enfermedades, como son las enfermedades neurodegenerativas, de alto impacto social y económico.

• Ana Belén Muñoz Manchado:
  • E-mail: ana.munoz@uca.es
  • ORCID: 0000-0002-1121-6072

• Redes genéticas reguladoras de la enfermedad de Parkinson. Responsable: Ana B. Muñoz Manchado

Enfermedades neurodegenerativas Parkinson Secuenciación de célula única Estriado Transcriptoma

• Investigadores/as Responsables:
  • Ana Belén Muñoz Manchado (IR).
• Investigadores/as:
  • Juan Manuel Barba Reyes.
  • Mónica Díez Salguero.
  • Gabriel Gonzalez Ulloa.
  • Begoña Zapata Macias.
  • Jose Maria Lopez-Cepero.

• Ministerio de Ciencia e Innovación. Proyectos de I+D+I, 2019, Retos Investigación y Generación del Conocimiento. PID2019-109046GA-I00. Redes Genéticas Reguladoras en la Enfermedad de Parkinson. Investigadora principal: Ana Muñoz.
• Programa Ramón y Cajal. Ministerio de Ciencia e Innovación. Gobierno de España. Investigadora principal: Ana Muñoz.

1. Munguba, H; Chattopadhyaya, B; Nilsson, S; Carrico, JN; Memic, F; Oberst, P; Batista-Brito, R; Munoz-Manchado, AB; Wegner, M; Fishell, G; Di Cristo, G; Hjerling-Leffler, J-Postnatal Sox6 Regulates Synaptic Function of Cortical Parvalbumin-Expressing Neurons-JOURNAL OF NEUROSCIENCE-2021-41-438876-8886–10.1523/JNEUROSCI.0021-21.2021. QJCR2020:Q1-6,167.

1. [Todas son revistas de Q1].

1. Qian X, Harris KD, HAuling T, Nicoloutsopoulos D, Muñoz-Manchado AB, Skene N, Hjerling-Leffler J, Nilsson M. Probabilistic cell typing enables fine mapping of closely related cell types in situ. Nature Methods, 2020; 17(1):101-106. PMID: 31740815. IF: 30.822.

1. [Todas son revistas de Q1].

1. Jansen PR, Watanabe K, Stringer S, Skene N, Bryois J, Hammerschlag AR, de Leeuw CA, Benjamins JS, Muñoz-Manchado AB, Nagel M, Savage JE, Tiemeier H, White T; 23andMe Research Team, Tung JY, Hinds DA, Vacic V, Wang X, Sullivan PF, van der Sluis S, Polderman TJC, Smit AB, Hjerling-Leffler J, Van Someren EJW, Posthuma D. Genome-wide analysis of insomnia in 1,331,010 individuals identifies new risk loci and functional pathways. Nature Genetics. 2019; 51(3):394-403. PMID: 30804565. IF: 31.077.

1. [Todas son revistas de Q1].

1. Muñoz-Manchado AB*, Bengtsson-Gonzales C*, Zeisel A*, Munguba H, Bekkouche B, Skene NG, Lonnerberg P, Ryge J, Harris K, Linnarsson, S, Hjerling-Leffler J. Diversity of interneurons in the dorsal striatum revealed by single-cell RNA-sequencing and PatchSeq. Cell Reports 2018, 21;24(8):2179-2190.e7. PMID: 30134177. IF: 7.815.
2. Savage JE et al (118/27). Genome-wide association meta-analysis in 269,867 individuals identifies new genetic and functional links to intelligence. Nature Genetics. 2018;50(7):912-919. PMID: 29942086. IF: 31.077.
3. Nagel M, Jansen PR, Stringer S, Watanabe K, de Leeuw CA, Bryois J, Savage JE, Hammerschlag AR, Skene NG, Muñoz-Manchado AB; 23andMe Research Team, White T, Tiemeier H, Linnarsson S, Hjerling-Leffler J, Polderman TJC, Sullivan PF, van der Sluis S, Posthuma D. Meta-analysis of genome-wide association studies for neuroticism in 449,484 individuals identifies novel genetic loci and pathways. Nature Genetics. 2018 50(7):920-927. doi: 10.1038/s41588-018-0151-7. PMID: 29942085. IF: 31.077.
4. Skene NG, Bryois J, Bakken TE, Breen G, Crowley JJ, Gaspar H, Giusti-Rodriguez P, Hodge RD, Miller JA, Muñoz-Manchado AB, O’Donovan MC, Owen MJ, Pardinas AF, Ryge J, Walters JTR, Linnarsson S, Lein EdS, Sullivan PF, Hjerling-Leffler J.“Genetic identification of brain cell types underlying schizophrenia”. Nature Genetics, 2018, 50(6):825-833. PMID: 29785013. IF: 31.077.
5. Coleman JRI, Bryois J, Gaspar HA, Jansen PR, Savage JE, Skene N, Plomin R, Muñoz-Manchado AB, Linnarsson S, Crawford G, Hjerling-Leffler J, Sullivan PF, Posthuma D, Breen G. “Biological annotation of genetic loci associated with intelligence in a meta-analysis of 87,740 individuals”. Molecular Psychiatry, 2018. PMID: 29520040. IF:11.973.
6. Perez-Villalba A, Sirerol-Piquer MS, Belenguer G, Soriano-Cantón R, Muñoz-Manchado AB, Villadiego J, Alarcón-Arís D, Soria FN, Dehay B, Bezard E, Vila M, Bortolozzi A, Toledo-Aral JJ, Pérez-Sánchez F, Fariñas I. “Synaptic Regulator α-Synuclein in Dopaminergic Fibers Is Essentially Required for the Maintenance of Subependymal Neural Stem Cells”. Journal of Neuroscience, 2018, Jan 24; 38(4): 814-825. PMID: 29217686. IF: 6.074.

1. * Equal contributions.

1. [Todas son revistas de Q1].

1. Nguyen HT, Bryois J, Kim A, Dobbyn A, Huckins LM, Muñoz-Manchado AB, Ruderfer DM, Genovese G, Fromer M, Xu X, Pinto D, Linnarsson S, Verhage M, Smit AB, Hjerling-Leffler J, Buxbaum JD, Hultman C, Sklar P, Purcell SM, Lage K, He X, Sullivan PF, Stahl EA. Integrated Bayesian analysis of rare exonic variants to identify risk genes for schizophrenia and neurodevelopmental disorders. Genome Medicine, 2017, 20; 9(1): 114. PMID:29262854. IF: 8.898.

1. [Todas son revistas de Q1].

1. Muñoz-Manchado AB, Villadiego J, Romo-Madero S, Suarez-Luna N, Bermejo-Navas A, Rodriguez-Gomez JA, Garrido-Gil P, Labandeira-Garcia JL, Echevarria M, Lopez-Barneo J, Toledo-Aral JJ. Chronic and progressive Parkinson’s disease MPTP model in adult and aged mice. Journal of Neurochemistry, 2016, 136; 2 373-87. PMID: 26500044. IF: 4.083.
2. Muñoz-Manchado AB*, Foldi C*, Szydlowski S*, Sjulson L, Farries M, Wilson C, Silberberg G, Hjerling-Leffler J. Novel Striatal GABAergic Interneuron Populations Labeled in the 5HT3a(EGFP) Mouse. Cerebral cortex, 2016, 26;1 96-105. PMID: 25146369. IF:8.665.
3. Marques S, Zeisel A, Codeluppi S, van Bruggen D, Mendanha Falcão A, Xiao L, Li H, Häring M, Hochgerner H, Romanov RA, Gyllborg D, Muñoz-Manchado AB, La Manno G, Lönnerberg P, Floriddia EM, Rezayee F, Ernfors P, Arenas E, Hjerling-Leffler J, Harkany T, Richardson WD, Linnarsson S, Castelo-Branco G. Oligodendrocyte heterogeneity in the mouse juvenile and adult central nervous system. Science, 2016, 352; 6291 1326-9. PMID: 27284195. IF: 37.205.

1. * Equal contributions.

1. [Todas son revistas de Q1].

1. Zeisel A*, Muñoz-Manchado AB*, Codeluppi S, Lönnerberg P, La Manno G, Juréus A, Marques S, Munguba H, He L, Betsholtz C, Rolny C, Castelo-Branco G, Hjerling-Leffler J, Linnarsson S. Brain structure. Cell types in the mouse cortex and hippocampus revealed by single-cell RNA-seq. Science, 2015, 347; 6226 1138-42. PMID: 25700174. IF: 34.665.

1. * Equal contributions.

1. [Todas son revistas de Q1].

1. Ortega-Saenz P, Pardal R, Levitsky K, Villadiego J, Muñoz-Manchado AB, Duran R, Bonilla-Henao V, Arias-Mayenco I, Sobrino V, Ordonez A, Oliver M, Toledo-Aral JJ, Lopez-Barneo J. Cellular properties and chemosensory responses of the human carotid body. Journal of Physiology, 2013, 591;24 6157-73. PMID: 24167224. IP:4.544.
2. Muñoz-Manchado AB*, Villadiego J*, Suarez-Luna N, Bermejo-Navas A, Garrido-Gil P, Labandeira-Garcia JL, Echevarria M, Lopez-Barneo J, Toledo-Aral JJ. Neuroprotective and reparative effects of carotid body grafts in a chronic MPTP model of Parkinson’s disease. Neurobiology of Aging, 2013, 34;3 902-15. PMID: 22743091. IF:4.853.

1. * Equal contributions.

1. [Todas son revistas de Q1].

1. Rodriguez-Pallares J, Joglar B, Muñoz-Manchado AB, Villadiego J, Tolde-Aral JJ, Labandeira-Garcia JL. Cografting of carotid body cells improves the long-term survival, fiber outgrowth and functional effects of grafted dopaminergic neurons. Regenerative Medicine, 2012, 7;3 309-22. PMID: 22594325. IF:3.873.