La Unidad de Genómica del INiBICA tiene como objetivo principal proporcionar al personal investigador equipos de última generación, fomentando así el desarrollo de una destacada investigación biomédica traslacional.
Realiza asesoramiento científico y técnico para el desarrollo de nuevos métodos de análisis en la expresión del ARN, la variabilidad del ADN y la caracterización de la función de los genes. La Unidad ofrece las herramientas necesarias para todas las fases de los análisis genómicos que abarcan desde la preparación de la muestra hasta el análisis y la entrega de datos a los investigadores.
EQUIPAMIENTO
- U.I.H.U.P.M:
- Secuenciador NGS MiSeq (Illumina).
- Secuenciador MinION MK1C (Oxford Nanopore Technologies).
- Secuenciador SeqStudio Genetic Analyzer System (Applied Byosystems).
- Estación qPCR QuantStudio 12k Flex (Applied Byosystems).
- Estación automatizada Accufill para OpenArray (Applied Byosystems).
- Estación automatizada de electroforesis capilar QSep100 (Bioptic Inc.).
- Termociclador de gradiente Blue-Ray (Biotech).
- Seleccionador de fragmentos automatizado Pippin Prep (Age science).
- Termociclador GENEAMP PCR System 2700 (Applied Byosystems).
- PCR cuantitativa en tiempo real ROTOR-GENE 6000 (Corbett).
- PCR cuantitativa en tiempo real CFX Connect (Biorad).
- Molecular imager, FX (BIORAD).
- Fuente electrophoresis PowerPac Basic (Biorad).
- Cubeta de electroforesis SEQ-3341 (SCIE-PLAS).
- Cubeta de electroforesis DNA SUBCELL (BIORAD).
- Documentador de geles GelDoc Go (BioRad).
- Agitador térmico Thermomixer C (Eppendorf).
- BD Rhapsody Single-Cell Analysis System (BDBiosciences).
- Termociclador C 1000 Touch (BioRad).
- SC-IBM UCA:
- PCR cuantitativa en tiempo real CFX Connect Biorad.
- PCR digital (QX200 Digital PCR Reader. Droplet Generator. Plate Sealer. C1000 Deep.
- Termociclador icycler tiempo final Biorad.
- Cubeta electroforesis vertical Mini-Protean Biorad Tetra System.
- Cubeta electroforesis horizontal, grande y pequeña.
- Thermo shaker TS-100C Biosan.
- Fuente Hoefer EPS2A200.
- Fuente PowerPac Basic Biorad.
- Mini Gel-Caster Biorad.
APLICACIONES
- Obtención de ácidos nucleicos de distintas muestras biológicas.
- PCR convencional, amplificación mediante PCR Simple, múltiple o anidada.
- PCR Real Time.
- Estudios de cuantificación absoluta o relativa de expresión génica.
- Estudios de discriminación alélica mediante sondas TaqMan.
- Secuenciación sanger de productos de PCR y plásmidos.
- Metagenómica.
- Secuenciación de paneles.
- Secuenciación de genoma completo microbiano.
- Análisis de fragmentos.
- Marcaje y captura de célula única.
- Asesoramiento técnico y elaboración conjunta de proyectos.
SERVICIOS
- Extracción de ácidos nucleicos.
- Purificación de ácidos nucleicos.
- Cuantificación de ácidos nucleicos por espectrofotometría y fluorimetría.
- Análisis de calidad, pureza e integridad de ácidos nucleicos.
- Lectura de resultados por electroforesis capilar y en geles de agarosa.
- Elaboración de librerías para secuenciación NGS y de fragmentos largos.
- Control de calidad de librerías (electroforesis capilar y fluorimetría).
- Secuenciación NGS y de fragmentos largos.
- Secuenciación Sanger y análisis de fragmentos.
- Proyectos qPCR y OpenArray.
- Uso (sin técnico) de equipamiento (solo para usuarios internos debidamente capacitados en el uso del equipo).
- Uso (con técnico) según necesidad del investigado.
PERSONAS DE CONTACTO
- SC-IBM UCA: dg.recursoscientificos@uca.es.
- U.I.H.U.P.M: gema.jimenez.g.sspa@juntadeandalucia.es.
- Técnico Especialista Genómica: Estefanía Jurado, PhD (estefania.jurado@inibica.es / genomica@inibica.es).
- Teléfono: (+34) 956 003 041 / Interno: 403 041.
