PROTEÓMICA
La Unidad de Proteómica, perteneciente a los Servicios Centrales de Investigación Biomédica de la Universidad de Cádiz, ofrece servicios analíticos a la comunidad científica del INiBICA y de la Universidad de Cádiz, pero también a cualquier investigador de otras universidades, hospitales y empresas.
La Unidad tiene dos líneas principales: (i) una plataforma de cromatografía líquida-espectrometría de masas (LC-MS) para la realización de análisis proteómicos masivos, tanto cualitativos como cuantitativos; y (ii) una plataforma de imagen molecular basada en espectrometría de masas (MALDI Imaging) que proporciona información sobre la situación de proteínas, péptidos, lípidos y metabolitos directamente sobre cortes tisulares.
Como servicio de apoyo a la actividad investigadora, la Unidad de Proteómica proporciona soporte personalizado a cada proyecto, pudiendo incluir las etapas previas y posteriores al análisis: diseño de experimentos, revisión de proyectos, análisis bioinformático e interpretación biológica de los datos generados.
EQUIPAMIENTO
- Espectrómetro de masas Q-TOF con movilidad iónica: Tims-TOF Pro (Bruker).
- Espectrómetro de masas MALDI-TOF/TOF: Autoflex Speed (Bruker).
- nanoHPLC: nanoElute (Bruker).
- Sprayer: HTX M3.
- Principales programas utilizados para análisis de datos: combinación de motores de búsqueda (Peaks, X!Tandem, MSGF+ y Comet), Peaks y Spectronaut para proteómica cuantitativa diaPASEF, Skyline para PRM-PASEF; SCILS para MALDI-Imaging, MBT Compass Library para MALDI Biotyper.
SERVICIOS
- Identificación y caracterización de proteínas por nanoHPLC-MS/MS DDA-PASEF y búsqueda en base de datos.
- Aplicaciones especializadas:
- Identificación masiva de proteínas.
- Identificación de PTMs.
- Metaproteómica.
- Proteómica cuantitativa:
- DIA (data-independent acquisition): diaPASEF.
- Label-free.
- Targeted Proteomics: PRM-PASEF.
- Aplicaciones especializadas:
- Expresión diferencial en dos o más grupos de muestras.
- Descubrimiento / validación de biomarcadores.
- Caracterización de mecanismos moleculares.
- Cuantificación de PTMs.
- MALDI Imaging.
- MALDI Biotyper (identificación de cepas y especies de microorganismos por MALDI-TOF).
- Revisión de propuestas a convocatorias de proyectos.
- Colaboración en proyectos de investigación.
- Formación en herramientas proteómicas y bioinformáticas.
TARIFAS
Si tiene algún problema para descargar el archivo mencionado anteriormente, puede acceder al mismo a través del siguiente enlace.
PERSONAS DE CONTACTO
- Dra. Mª Carmen Durán Ruiz: maricarmen.duran@gm.uca.es
DIRECCIÓN POSTAL
Unidad de Proteómica.
Servicios Centrales de Investigación en Ciencias de la Salud.
Edificio de Asuntos Generales, Universidad de Cádiz.
C/ Doctor Marañón, 3, planta 3. 11002, Cádiz, España.